Nel primo turno eliminatorio di Coppa Itala di serie C partecipano 56 delle 60 squadre partecipanti al campionato. Il Messina è stato inserito nel gruppo 4 e nel primo turno affronterà fuori casa, il 21 agosto, la Juve Stabia. Si tratta di un unico match ad eliminazione diretta.
Nel secondo turno eliminatorio, anche questo con match unico, la vincente di Juve Stabia-Messina affronterà fuori casa, il 15 settembre, la vincente di Foggia-Paganese.
Seguirà per le vincenti i turni degli ottavi di finali (3 novembre) e quarti di finale (24 novembre), anch’essi con un unico match eliminatorio, le semifinali (15 dicembre e 19 gennaio) e la finale con gare di andata e ritorno (2 marzo e 5 aprile).